Auszug aus dem Link:

Ogg Vorbis, MPC und FLAC
Bei diesen Formaten haben die Entwickler flexibles ReplayGain direkt im Standard des Formates integriert. Leider bedeutet dies nicht, dass jeder Player zwangsläufig in der Lage sein muss, die entsprechenden Tags auch auszulesen.

Daraus folgt: Da Replaygain Teil des Ogg-Standards ist, muß nur der Replaygain-Wert verändert werden, um die Datei anzupassen, nicht jedoch die eigentliche Datei, wie es z.B. bei mp3s der Fall wäre:

MP3
Die Lautstärke von MP3-Dateien lässt sich mit Hilfe von MP3Gain und foobar2000 anpassen. Während beide Programme das Schreiben von flexiblen ReplayGain-Tags ermöglichen, ist MP3Gain momentan die einzige Anwendung, die das direkte Manipulieren der Audiodaten unterstützt.