Flac wird als externer Encoder installiert. "%s %d" als Platzhalter im Parameterfeld übermitteln dem Encoder den Namen der Quell- und Zieldatei. Wie eine Parameterzeile für FLAC auszusehen hat steht tausendfach im Internet.
Die Forensuche hätte Dir helfen können: http://forum.audiograbber.de/index.php/topic,1212.0.html